Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LSAMPQ13449 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LSAMPQ13449 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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