Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3B2Q13367 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3B2Q13367 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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