Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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SCGB2A2Q13296 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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