Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms