Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPS1Q13098 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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