Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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TRAF1Q13077 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
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TRAF1Q13077 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
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TRAF1Q13077 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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TRAF1Q13077 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
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TRAF1Q13077 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
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TRAF1Q13077 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
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TRAF1Q13077 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF1Q13077 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
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TRAF1Q13077 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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TRAF1Q13077 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
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TRAF1Q13077 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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TRAF1Q13077 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
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TRAF1Q13077 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
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