Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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LMAN2Q12907 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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LMAN2Q12907 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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LMAN2Q12907 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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LMAN2Q12907 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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LMAN2Q12907 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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LMAN2Q12907 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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