Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXO1Q12778 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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