Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SREBF2Q12772 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
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