Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms