Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms