Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB2Q08289 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms