Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF4Q08170 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms