Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms