Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLEQ07864 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLEQ07864 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLEQ07864 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLEQ07864 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLEQ07864 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POLEQ07864 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLEQ07864 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POLEQ07864 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLEQ07864 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLEQ07864 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLEQ07864 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLEQ07864 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLEQ07864 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLEQ07864 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLEQ07864 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLEQ07864 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLEQ07864 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POLEQ07864 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLEQ07864 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLEQ07864 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLEQ07864 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLEQ07864 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLEQ07864 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLEQ07864 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLEQ07864 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLEQ07864 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLEQ07864 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLEQ07864 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLEQ07864 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLEQ07864 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLEQ07864 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLEQ07864 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLEQ07864 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLEQ07864 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLEQ07864 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POLEQ07864 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POLEQ07864 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLEQ07864 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLEQ07864 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLEQ07864 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLEQ07864 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLEQ07864 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLEQ07864 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLEQ07864 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLEQ07864 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLEQ07864 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLEQ07864 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLEQ07864 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLEQ07864 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLEQ07864 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLEQ07864 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLEQ07864 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLEQ07864 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLEQ07864 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLEQ07864 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLEQ07864 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLEQ07864 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLEQ07864 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLEQ07864 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLEQ07864 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLEQ07864 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
POLEQ07864 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
POLEQ07864 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLEQ07864 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
POLEQ07864 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLEQ07864 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLEQ07864 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
POLEQ07864 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLEQ07864 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms