Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CXCL9Q07325 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CXCL9Q07325 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms