Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms