Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FMODQ06828 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FMODQ06828 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FMODQ06828 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FMODQ06828 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FMODQ06828 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FMODQ06828 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FMODQ06828 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FMODQ06828 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FMODQ06828 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FMODQ06828 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FMODQ06828 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms