Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms