Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATP7AQ04656 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms