Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ERCC6Q03468 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ERCC6Q03468 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms