Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 LINC02057-201ENST00000503882 640 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 AL590004.3-201ENST00000450255 443 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 H3F3A-203ENST00000366815 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms