Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms