Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms