Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDK17Q00537 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK17Q00537 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms