Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXO4P98177 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXO4P98177 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms