Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
JAG1P78504 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
JAG1P78504 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
JAG1P78504 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
JAG1P78504 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
JAG1P78504 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
JAG1P78504 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
JAG1P78504 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
JAG1P78504 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
JAG1P78504 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
JAG1P78504 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
JAG1P78504 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
JAG1P78504 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
JAG1P78504 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
JAG1P78504 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
JAG1P78504 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
JAG1P78504 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
JAG1P78504 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
JAG1P78504 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
JAG1P78504 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
JAG1P78504 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
JAG1P78504 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
JAG1P78504 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
JAG1P78504 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
JAG1P78504 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
JAG1P78504 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
JAG1P78504 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
JAG1P78504 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
JAG1P78504 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
JAG1P78504 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
JAG1P78504 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
JAG1P78504 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
JAG1P78504 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
JAG1P78504 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
JAG1P78504 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
JAG1P78504 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
JAG1P78504 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
JAG1P78504 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
JAG1P78504 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
JAG1P78504 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
JAG1P78504 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
JAG1P78504 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
JAG1P78504 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
JAG1P78504 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
JAG1P78504 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
JAG1P78504 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
JAG1P78504 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
JAG1P78504 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
JAG1P78504 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
JAG1P78504 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
JAG1P78504 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
JAG1P78504 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
JAG1P78504 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
JAG1P78504 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
JAG1P78504 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
JAG1P78504 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
JAG1P78504 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
JAG1P78504 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
JAG1P78504 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
JAG1P78504 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
JAG1P78504 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
JAG1P78504 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
JAG1P78504 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
JAG1P78504 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
JAG1P78504 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
JAG1P78504 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
JAG1P78504 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
JAG1P78504 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
JAG1P78504 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
JAG1P78504 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
JAG1P78504 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
JAG1P78504 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
JAG1P78504 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
JAG1P78504 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
JAG1P78504 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
JAG1P78504 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
JAG1P78504 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
JAG1P78504 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
JAG1P78504 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
JAG1P78504 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
JAG1P78504 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
JAG1P78504 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
JAG1P78504 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
JAG1P78504 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
JAG1P78504 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
JAG1P78504 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
JAG1P78504 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
JAG1P78504 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
JAG1P78504 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
JAG1P78504 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
JAG1P78504 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
JAG1P78504 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
JAG1P78504 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
JAG1P78504 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
JAG1P78504 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
JAG1P78504 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
JAG1P78504 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
JAG1P78504 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
JAG1P78504 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
JAG1P78504 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms