Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms