Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB1P62873 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB1P62873 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GNB1P62873 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GNB1P62873 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GNB1P62873 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GNB1P62873 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB1P62873 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms