Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD2P62316 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPD2P62316 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPD2P62316 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPD2P62316 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPD2P62316 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPD2P62316 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPD2P62316 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPD2P62316 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPD2P62316 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPD2P62316 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPD2P62316 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPD2P62316 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPD2P62316 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPD2P62316 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPD2P62316 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPD2P62316 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPD2P62316 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPD2P62316 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms