Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVPABLB-1P60509 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms