Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMP4BP1P59074 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4BP1P59074 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms