Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GFRA1P56159 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms