Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC13P55735 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC13P55735 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC13P55735 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC13P55735 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC13P55735 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC13P55735 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC13P55735 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC13P55735 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC13P55735 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC13P55735 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC13P55735 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC13P55735 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC13P55735 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC13P55735 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC13P55735 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC13P55735 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC13P55735 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC13P55735 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC13P55735 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC13P55735 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC13P55735 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC13P55735 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC13P55735 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC13P55735 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC13P55735 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC13P55735 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC13P55735 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC13P55735 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC13P55735 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC13P55735 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC13P55735 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC13P55735 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC13P55735 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC13P55735 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC13P55735 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC13P55735 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC13P55735 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC13P55735 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC13P55735 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC13P55735 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC13P55735 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC13P55735 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC13P55735 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC13P55735 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC13P55735 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC13P55735 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC13P55735 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC13P55735 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC13P55735 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC13P55735 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC13P55735 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC13P55735 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC13P55735 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC13P55735 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC13P55735 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC13P55735 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC13P55735 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC13P55735 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC13P55735 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC13P55735 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC13P55735 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC13P55735 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC13P55735 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC13P55735 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC13P55735 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC13P55735 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC13P55735 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC13P55735 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC13P55735 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC13P55735 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC13P55735 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC13P55735 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC13P55735 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC13P55735 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC13P55735 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC13P55735 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC13P55735 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC13P55735 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC13P55735 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC13P55735 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC13P55735 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC13P55735 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC13P55735 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC13P55735 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC13P55735 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC13P55735 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC13P55735 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC13P55735 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC13P55735 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC13P55735 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC13P55735 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC13P55735 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC13P55735 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC13P55735 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC13P55735 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC13P55735 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC13P55735 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC13P55735 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC13P55735 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms