Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP7P55210 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP7P55210 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP7P55210 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP7P55210 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP7P55210 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP7P55210 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP7P55210 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP7P55210 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP7P55210 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP7P55210 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP7P55210 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP7P55210 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP7P55210 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP7P55210 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP7P55210 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP7P55210 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP7P55210 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP7P55210 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP7P55210 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP7P55210 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP7P55210 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP7P55210 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP7P55210 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP7P55210 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP7P55210 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP7P55210 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP7P55210 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP7P55210 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP7P55210 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP7P55210 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP7P55210 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP7P55210 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP7P55210 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP7P55210 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP7P55210 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP7P55210 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP7P55210 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP7P55210 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP7P55210 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP7P55210 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP7P55210 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP7P55210 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP7P55210 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP7P55210 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP7P55210 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP7P55210 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP7P55210 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP7P55210 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP7P55210 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP7P55210 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP7P55210 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP7P55210 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP7P55210 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP7P55210 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP7P55210 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP7P55210 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP7P55210 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP7P55210 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP7P55210 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP7P55210 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP7P55210 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP7P55210 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP7P55210 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP7P55210 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP7P55210 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP7P55210 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP7P55210 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP7P55210 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP7P55210 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP7P55210 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP7P55210 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP7P55210 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP7P55210 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP7P55210 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP7P55210 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP7P55210 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP7P55210 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP7P55210 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP7P55210 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP7P55210 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP7P55210 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP7P55210 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP7P55210 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP7P55210 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP7P55210 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP7P55210 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP7P55210 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP7P55210 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP7P55210 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP7P55210 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CASP7P55210 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP7P55210 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP7P55210 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP7P55210 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP7P55210 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP7P55210 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP7P55210 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP7P55210 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP7P55210 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms