Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNB3P54284 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms