Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDST1P52848 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDST1P52848 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDST1P52848 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDST1P52848 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDST1P52848 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NDST1P52848 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDST1P52848 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDST1P52848 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDST1P52848 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDST1P52848 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDST1P52848 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDST1P52848 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDST1P52848 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDST1P52848 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDST1P52848 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDST1P52848 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDST1P52848 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDST1P52848 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDST1P52848 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDST1P52848 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDST1P52848 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDST1P52848 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDST1P52848 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDST1P52848 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDST1P52848 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDST1P52848 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDST1P52848 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDST1P52848 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDST1P52848 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDST1P52848 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDST1P52848 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDST1P52848 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDST1P52848 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDST1P52848 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDST1P52848 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NDST1P52848 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDST1P52848 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDST1P52848 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDST1P52848 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDST1P52848 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDST1P52848 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NDST1P52848 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDST1P52848 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDST1P52848 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDST1P52848 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDST1P52848 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDST1P52848 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NDST1P52848 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NDST1P52848 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDST1P52848 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDST1P52848 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDST1P52848 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDST1P52848 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDST1P52848 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDST1P52848 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDST1P52848 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDST1P52848 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDST1P52848 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDST1P52848 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDST1P52848 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDST1P52848 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDST1P52848 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDST1P52848 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDST1P52848 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDST1P52848 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDST1P52848 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDST1P52848 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDST1P52848 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDST1P52848 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDST1P52848 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDST1P52848 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDST1P52848 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms