Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A2P52657 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A2P52657 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms