Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERFP50548 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERFP50548 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERFP50548 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERFP50548 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERFP50548 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERFP50548 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERFP50548 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERFP50548 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERFP50548 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERFP50548 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERFP50548 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERFP50548 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERFP50548 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ERFP50548 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERFP50548 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERFP50548 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERFP50548 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERFP50548 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERFP50548 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERFP50548 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERFP50548 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERFP50548 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERFP50548 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERFP50548 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERFP50548 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERFP50548 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERFP50548 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ERFP50548 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERFP50548 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERFP50548 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERFP50548 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERFP50548 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERFP50548 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERFP50548 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERFP50548 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERFP50548 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERFP50548 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERFP50548 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERFP50548 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERFP50548 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERFP50548 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERFP50548 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERFP50548 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERFP50548 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERFP50548 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERFP50548 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERFP50548 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERFP50548 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERFP50548 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERFP50548 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERFP50548 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ERFP50548 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ERFP50548 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERFP50548 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERFP50548 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERFP50548 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERFP50548 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERFP50548 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERFP50548 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERFP50548 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERFP50548 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERFP50548 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERFP50548 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERFP50548 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERFP50548 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERFP50548 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERFP50548 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERFP50548 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERFP50548 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERFP50548 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERFP50548 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERFP50548 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERFP50548 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERFP50548 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERFP50548 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERFP50548 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERFP50548 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERFP50548 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERFP50548 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERFP50548 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERFP50548 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERFP50548 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERFP50548 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERFP50548 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERFP50548 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERFP50548 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERFP50548 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERFP50548 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERFP50548 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERFP50548 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERFP50548 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERFP50548 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERFP50548 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERFP50548 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERFP50548 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERFP50548 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERFP50548 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERFP50548 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERFP50548 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms