Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPFP49454 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPFP49454 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPFP49454 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPFP49454 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPFP49454 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPFP49454 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPFP49454 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPFP49454 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPFP49454 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPFP49454 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPFP49454 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPFP49454 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPFP49454 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPFP49454 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPFP49454 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPFP49454 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPFP49454 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPFP49454 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPFP49454 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPFP49454 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPFP49454 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPFP49454 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPFP49454 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPFP49454 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPFP49454 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPFP49454 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPFP49454 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPFP49454 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPFP49454 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPFP49454 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPFP49454 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPFP49454 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPFP49454 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPFP49454 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPFP49454 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPFP49454 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPFP49454 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPFP49454 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPFP49454 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPFP49454 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPFP49454 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPFP49454 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPFP49454 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPFP49454 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPFP49454 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPFP49454 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPFP49454 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPFP49454 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPFP49454 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPFP49454 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPFP49454 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPFP49454 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPFP49454 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPFP49454 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPFP49454 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPFP49454 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPFP49454 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPFP49454 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPFP49454 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPFP49454 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPFP49454 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPFP49454 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPFP49454 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPFP49454 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPFP49454 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPFP49454 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPFP49454 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPFP49454 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPFP49454 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPFP49454 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPFP49454 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPFP49454 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms