Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK8P49336 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK8P49336 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK8P49336 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK8P49336 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK8P49336 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK8P49336 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK8P49336 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK8P49336 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK8P49336 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK8P49336 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK8P49336 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK8P49336 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK8P49336 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK8P49336 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK8P49336 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK8P49336 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK8P49336 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK8P49336 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK8P49336 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK8P49336 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK8P49336 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK8P49336 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK8P49336 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK8P49336 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK8P49336 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK8P49336 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK8P49336 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK8P49336 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK8P49336 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK8P49336 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK8P49336 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK8P49336 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK8P49336 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK8P49336 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK8P49336 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK8P49336 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK8P49336 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK8P49336 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK8P49336 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK8P49336 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK8P49336 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK8P49336 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK8P49336 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK8P49336 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK8P49336 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK8P49336 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK8P49336 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK8P49336 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK8P49336 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK8P49336 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK8P49336 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK8P49336 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK8P49336 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK8P49336 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK8P49336 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK8P49336 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK8P49336 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK8P49336 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK8P49336 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK8P49336 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK8P49336 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK8P49336 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK8P49336 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK8P49336 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK8P49336 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK8P49336 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK8P49336 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK8P49336 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK8P49336 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK8P49336 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK8P49336 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK8P49336 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK8P49336 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK8P49336 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK8P49336 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK8P49336 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK8P49336 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK8P49336 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK8P49336 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK8P49336 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK8P49336 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK8P49336 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK8P49336 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK8P49336 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK8P49336 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK8P49336 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK8P49336 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK8P49336 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK8P49336 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK8P49336 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK8P49336 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK8P49336 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK8P49336 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK8P49336 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK8P49336 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK8P49336 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK8P49336 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK8P49336 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK8P49336 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms