Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NESP48681 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
NESP48681 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NESP48681 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NESP48681 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NESP48681 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NESP48681 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NESP48681 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NESP48681 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NESP48681 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
NESP48681 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NESP48681 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NESP48681 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NESP48681 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NESP48681 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
NESP48681 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NESP48681 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NESP48681 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NESP48681 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NESP48681 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NESP48681 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NESP48681 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NESP48681 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NESP48681 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NESP48681 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NESP48681 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NESP48681 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NESP48681 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NESP48681 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NESP48681 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NESP48681 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NESP48681 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NESP48681 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NESP48681 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
NESP48681 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NESP48681 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NESP48681 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NESP48681 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NESP48681 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NESP48681 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NESP48681 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NESP48681 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NESP48681 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NESP48681 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
NESP48681 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NESP48681 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NESP48681 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NESP48681 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NESP48681 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NESP48681 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NESP48681 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NESP48681 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NESP48681 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NESP48681 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NESP48681 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NESP48681 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
NESP48681 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NESP48681 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
NESP48681 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
NESP48681 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
NESP48681 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
NESP48681 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NESP48681 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
NESP48681 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
NESP48681 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
NESP48681 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
NESP48681 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC34.57■■■■□ 3.12
NESP48681 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NESP48681 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
NESP48681 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NESP48681 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NESP48681 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NESP48681 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NESP48681 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NESP48681 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NESP48681 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NESP48681 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NESP48681 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NESP48681 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NESP48681 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
NESP48681 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
NESP48681 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NESP48681 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NESP48681 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NESP48681 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NESP48681 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NESP48681 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NESP48681 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NESP48681 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
NESP48681 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NESP48681 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NESP48681 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NESP48681 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NESP48681 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NESP48681 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NESP48681 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NESP48681 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NESP48681 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NESP48681 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NESP48681 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms