Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIP4K2AP48426 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms