Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms