Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACAA2P42765 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms