Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTGDSP41222 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDSP41222 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms