Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTPDP35247 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms