Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTX2P32243 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTX2P32243 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTX2P32243 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTX2P32243 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTX2P32243 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTX2P32243 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTX2P32243 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTX2P32243 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTX2P32243 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTX2P32243 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTX2P32243 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTX2P32243 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTX2P32243 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTX2P32243 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTX2P32243 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTX2P32243 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTX2P32243 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTX2P32243 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTX2P32243 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTX2P32243 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTX2P32243 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTX2P32243 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTX2P32243 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTX2P32243 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTX2P32243 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTX2P32243 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
OTX2P32243 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTX2P32243 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTX2P32243 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTX2P32243 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTX2P32243 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
OTX2P32243 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTX2P32243 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTX2P32243 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTX2P32243 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTX2P32243 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTX2P32243 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTX2P32243 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTX2P32243 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTX2P32243 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTX2P32243 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTX2P32243 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTX2P32243 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTX2P32243 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTX2P32243 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTX2P32243 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTX2P32243 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTX2P32243 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTX2P32243 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTX2P32243 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTX2P32243 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTX2P32243 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTX2P32243 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTX2P32243 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTX2P32243 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTX2P32243 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTX2P32243 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTX2P32243 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTX2P32243 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTX2P32243 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTX2P32243 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTX2P32243 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX2P32243 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX2P32243 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX2P32243 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX2P32243 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX2P32243 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX2P32243 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX2P32243 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX2P32243 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX2P32243 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX2P32243 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX2P32243 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX2P32243 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX2P32243 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX2P32243 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX2P32243 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX2P32243 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTX2P32243 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX2P32243 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX2P32243 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX2P32243 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX2P32243 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX2P32243 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX2P32243 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX2P32243 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX2P32243 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX2P32243 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX2P32243 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX2P32243 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX2P32243 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX2P32243 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX2P32243 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX2P32243 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX2P32243 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX2P32243 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX2P32243 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX2P32243 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTX2P32243 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms