Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCKBRP32239 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKBRP32239 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms