Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC13P31276 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms